A WaterAid juntou-se aos esforços do MISAU para minimizar a propagação e o impacto da COVID-19 no país. As acções incluíram o desenvolvimento de um plano de resposta com actividades financiadas por vários doadores, incluindo Heineken Africa Foundation e Poul due Jensen Foundation. A WaterAid apostou na sensibilização para mudança de comportamento, através de campanhas com carro móvel e motovalas, que circularam nas cidades de Maputo e Matola, sensibilizando as populações sobre práticas de higiene para prevenção da COVID-19. Também juntou-se à produção e distribuição de materiais de comunicação para mudança de comportamento em diferentes línguas locais e fez a instalação de estações de lavagem de mãos nos espaços públicos em Maputo e Nampula.

Em Niassa, a WaterAid melhorou infra-estruturas de ASH em três unidades sanitárias destinadas a receber pacientes com COVID-19, distribuiu materiais de higiene e capacitou profissionais de saúde em 16 unidades sanitárias. Este trabalho foi financiado pela UNICEF e contribuiu também para uma avaliação rápida do estado de ASH das unidades sanitárias rurais da província.